Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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