Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp3Q91W36 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp3Q91W36 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp3Q91W36 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp3Q91W36 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp3Q91W36 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp3Q91W36 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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