Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms