Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cdk8Q8R3L8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdk8Q8R3L8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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