Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r188Q8K3N2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r188Q8K3N2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vmn1r188Q8K3N2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r188Q8K3N2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r188Q8K3N2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r188Q8K3N2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r188Q8K3N2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r188Q8K3N2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r188Q8K3N2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r188Q8K3N2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r188Q8K3N2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r188Q8K3N2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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