Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Abcf3Q8K268 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Abcf3Q8K268 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Abcf3Q8K268 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Abcf3Q8K268 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Abcf3Q8K268 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Abcf3Q8K268 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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