Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Rab11fip3Q8CHD8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip3Q8CHD8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip3Q8CHD8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rab11fip3Q8CHD8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms