Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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