Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms