Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp27Q8CEG8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp27Q8CEG8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp27Q8CEG8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp27Q8CEG8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp27Q8CEG8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp27Q8CEG8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp27Q8CEG8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms