Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ufl1Q8CCJ3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ufl1Q8CCJ3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms