Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp1Q8C8C1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp1Q8C8C1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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