Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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