Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdcl3Q8BVF2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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