Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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