Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan9Q8BJU2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms