Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ubash3bQ8BGG7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms