Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8BGC1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms