Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms