Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sys1Q78S06 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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