Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx13Q6PHS6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms