Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trak1Q6PD31 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms