Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms