Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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