Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms