Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms