Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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