Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim28Q62318 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim28Q62318 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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