Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sema3cQ62181 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms