Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms