Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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