Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa3Q3UPR0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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