Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UPC7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3UPC7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms