Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms