Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Tmprss11cQ1JRP2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmprss11cQ1JRP2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmprss11cQ1JRP2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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