Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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