Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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