Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms