Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms