Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms