Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms