Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Thbs3Q05895 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs3Q05895 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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