Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sox8Q04886 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms