Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NfiaQ02780 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms