Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms