Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja5Q01231 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms