Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms