Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmklr1P97468 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms