Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms