Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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